Trong chu kỳ bầu cử 2006 - 2011, Joy Atim đã được bầu vào Chính quyền địa phương quận Lira, phục vụ ở đó với tư cách là Ủy viên hội đồng quận. Năm 2011, bà tranh cử đại diện cho phụ nữ ở quận Lira trong Quốc hội khóa 9 (2011 đến 2016).[1] Trong lần đó, bà đã tranh cử như một ứng cử viên độc lập và giành chiến thắng.[2][3]

Trong cuộc bầu cử năm 2016, Atim đã tranh cử với tư cách thành viên của đảng chính trị Đảng Dân chủ đối lập ở Ucraina (UPC), được bầu lại và là dân biểu đương nhiệm. Bà là một trong những thành viên của quốc hội Uganda, người phản đối việc sửa đổi hiến pháp, để xóa bỏ giới hạn tuổi tổng thống.[4] Các cuộc biểu tình chính trị của bà đã bị Lực lượng cảnh sát Uganda nhắm đến, dẫn đến thương tích và phải nhập viện cho người tham gia.[5]